WH0126 lncRNA cDNA鏈合成

產品簡介
lncRNA cDNA鏈合成是高品質的基因結構和功能產品,由北京百奧萊博供應,本產品用于科研試驗,本產品質量好,且具價格,深為用戶稱道,了解更多lncRNA cDNA鏈合成等基因結構和功能產品請聯系我司咨詢訂購。...
產品詳細介紹
特別提示:包括lncRNA cDNA鏈合成試劑盒(去除基因組DNA)在內,本公司的所有產品僅可用于科研實驗,嚴禁用于臨床醫療及其他非科研用途!
產品名稱:lncRNA cDNA鏈合成試劑盒(去除基因組DNA)
英文名稱:lncRNA First-Strand cDNA Synthesis Kit (With gDNase)
產品貨號:WH0126
產品規格:20μl×25次|20μl×100次
本試劑盒是專門針對長鏈非編碼RNA (lncRNA)反轉錄而開發的產品。與mRNA相比,lncRNA具有豐度低、GC含量差異大、二級結構更復雜等特性,傳統反轉錄試劑對lncRNA難以達到理想的效果。本試劑盒含有去除基因組DNA的gDNase,通過42℃,3min即可去除RNA樣品中殘留的基因組DNA,可有效避免殘留的基因組DNA對后續PCR檢測結果的干擾。本試劑盒中lnR RT Enzyme Mix中使用的反轉錄酶為QuickKing RT Enzyme,此酶是通過分子改造后的反轉錄酶,特別增加了疏水motif,具有更強的RNA親和性和熱穩定性,從而進一步提高了其反轉錄效率和反應速率,42℃、15 min即可完成cDNA鏈的合成,且反轉錄長度至少可達10 kb。另外,酶與RNA親和力的更強,配合特殊優化過的緩沖體系和引物體系,使本試劑盒在通讀GC含量高,二級結構復雜,低豐度的RNA模板和抗逆性等方面表現突出,特別適合表達水平相對較低,二級結果相對復雜的lncRNA的反轉錄反應。
產品特點:
·性能:反轉錄效率可達95%以上,Total RNAzuì低檢測下限可達10ng,反轉錄長度可達10 kb以上。
·簡單快速:反應體系配制簡單,21 min完成lncRNA cDNA鏈的合成;
·適用廣泛:能夠通用于GC含量差異大,二級結構復雜,低豐度的RNA模板;對不同物種來源及雜質較多的RNA模板的適用性高;
·兼容性好:后續配合熒光定量檢測產品,靈敏度高、穩定性好。
試劑盒組成:
| 組分 | 25次 | 100次 |
| 5×gDNA Buffer | 50μl | 200 μl |
| lnR-RT Primer Mix | 50μl | 200 μl |
| lnR RT Enzyme Mix | 25 μl | 100 μl |
| 10×lnR RT Buffer | 50μl | 200 μl |
| RNase-Free ddH2O | 1ml | 2×1ml |
儲存條件:-20℃可保存一年。
注意事項:(請務必在使用本試劑盒之前閱讀此注意事項。)
1.下列操作步驟適用于模板量為10ng-2μg的Total RNA,如果Total RNA量大于2μg,請按比例擴大反應體系。
2.在冰上進行操作,防止RNA發生降解。
3.對于二級結構很復雜的RNA模板,推薦使用變性步驟,即在操作步驟之前,將模板RNA在65℃孵育5 min后迅速轉移到冰上,然后再進行下一步操作。
4.根據實驗需求不同,也可以選用Oligo-dT Primer或Gene Specific Primer,引物使用量:
Oligo-dT Primer 50pmol/20 μl反應體系,
Gene Specific Primer 5pmol/20 μl反應體系。
5.當PCR反應有非特異性擴增時,將反轉錄溫度升到50℃會有改善。
對RNA模板的要求:
反轉錄酶以RNA為模板合成鏈cDNA,模板RNA的質量和數量直接影響反轉錄的結果。
1.模板的完整性:模板RNA的完整性對反轉錄非常重要,若RNA模板中含有RNase酶將降解模板RNA,zuì后導致cDNA產物的量少甚至無cDNA產物。
2.模板的純度:若RNA模板中含有蛋白、鹽離子、EDTA、乙醇、酚等雜質,將影響反轉錄酶的活性,zuì后影響反轉錄結果。
3.模板的加量:上述操作步驟適用于模板RNA量為10ng-2μg,如果模板RNA的量大于2μg,請按比例擴大反應體系。
操作步驟:
10ng-2μg Total RNA可建立20 μl反應體系,具體過程如下所示:
1.將模板RNA在冰上解凍;5×gDNA Buffer、lnR-RT Primer Mix、10×lnR RT Buffer、RNase-Free ddH2O在室溫(15-25℃)解凍,解凍后迅速置于冰上。使用前將每種溶液渦旋振蕩混勻,簡短離心以收集殘留在管壁的液體。
注意:以下操作步驟請在冰上進行。為了保證反應液配制的準確性,進行各項反應時,應先配制成Mix,然后再分裝到每個反應管中。
2.按照表1的基因組DNA的去除體系配制混合液,徹底混勻。簡短離心,并置于42℃,孵育3min。然后置于冰上放置。
表1:gDNA去除反應體系
| 組分 | 用量 | 終濃度 |
| Total RNA | 10ng-2μg | |
| 5×gDNA Buffer | 2 μl | 1× |
| RNase-Free ddH2O | 補至10μl |
3.按照表2的反轉錄反應體系配制混合液。
表2:反轉錄反應體系
| 組分 | 用量 | 終濃度 |
| 10×lnR RT Buffer | 2 μl | 2× |
| lnR RT Enzyme Mix | 1 μl | - |
| lnR-RT Primer Mix | 2 μl | - |
| RNase-Free ddH2O | 補足到10 μl | - |
4.將反轉錄反應中的Mix加到gDNA去除步驟的反應液中,充分混勻后即完成20 μl反應體系。
5.42℃,孵育15 min。
6.95℃,孵育3min之后放于冰上,得到的cDNA可用于后續實驗,或低溫保存。
注意:
1.若后續實驗為實時熒光定量PCR,反轉錄產物的加量應不超過PCR體系終體積的1/10,例如50μl的PCR反應體系,反轉錄產物的加量應不超過5 μl。
2.反轉錄結束后,請將反轉錄產物置于冰上,再進行后續PCR反應配制;如果需要長時間保存,請置于-20℃。
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名稱:Amelogenin/MAME mRNA原位雜交試劑盒
貨號:ZN0054
規格:100T
基本信息:
保存條件:4℃保存一年
工作量:100張切片。
有效期:一年。
適用種屬:mouse
標記方式:3’—尾段標記
試劑盒中內容:
1.胃蛋白酶(×10; Pepsin)2ml;
2.預雜交液 2ml;
3.Amelogenin/MAME mRNA原位雜交試劑盒寡核苷酸探針雜交液 2ml;
4.封閉液 5ml;
5.生物素化鼠抗dì高辛 5ml;
6.SABC-POD 5ml;
7.生物素化過氧化物酶 5ml。
用戶自備試劑:
原位雜交專用蓋玻片;POLY-L-LYSINE;DEPC;20%甘油
緩沖液(3%檸檬酸,2×SSC,0.5×SSC,0.2×SSC,原位雜交用 PBS)
一.培養細胞和冰凍切片
準備工作:
固定液:4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6);1%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6)
3%檸檬酸——100ml蒸餾水中加檸檬酸(C6H8O7?H2O)3g,PH2.0左右。
2×SSC——1000ml蒸餾水中加氯化鈉17.6g,檸檬酸三鈉(C6H5O7Na3?2H2O,分子量294)8.8g。
0.5×SSC——300ml蒸餾水加100ml 2×SSC即可。
0.2×SSC——270ml蒸餾水加30ml 2×SSC即可。
20%甘油——20ml甘油加80ml蒸餾水即可。
原位雜交用PBS(1000ml蒸餾水加氯化鈉30g,Na2HPO4?12H2O 6g,NaH2PO4?2H2O 0.4g),PH7.2-7.6。
操作程序:
注意:zuì重要的是及時固定,并在固定液中加入0.1%的DEPC處理,以抑制RNA酶對mRNA的分解作用。此外,過度固定對原位雜交有明顯的不利影響。
1.玻片的處理:一般采用多聚賴氨酸或APES。切片厚度10-20μm。
2.細胞在多聚賴氨酸處理的蓋玻片上進行培養,條件為37℃和5%的CO2,所用培養基為Dulbecco基礎培養基。細胞長好后0.1M PBS(PH7.4)洗2分鐘×3次。
3.培養細胞和冰凍切片均可用下述方法固定:固定液為4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6),含有1/1000 DEPC。室溫固定 20--30分鐘。蒸餾水充分洗滌,干燥后-20℃冰凍可保存2周以上。
4.30%H2O2 1份+純甲醇50份混合,室溫處理30分鐘。蒸餾水洗滌3次。
5.暴露mRNA核酸片段:切片上滴加3%檸檬酸新鮮稀釋的胃蛋白酶(1ml 3% 檸檬酸加2滴濃縮型胃蛋白酶,混勻),37℃或室溫消化5—120秒鐘。有時也可以不消化。原位雜交用 PBS洗3次×5分鐘。蒸餾水洗1次。
6.后固定:胃蛋白酶消化后才需要。固定液為1%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6),含有1/1000 DEPC。室溫固定 10分鐘。蒸餾水洗滌3次。
7.預雜交:濕盒的準備——干的雜交盒底部加20%甘油20ml以保持濕度。按每張切片20μι加預雜交液。恒溫箱38-42℃2—4小時。吸取多余液體,不洗。
8.雜交——按每張切片20μι雜交液,加在切片上。將原位雜交專用蓋玻片的保護膜揭開后,蓋在切片上。恒溫箱38-42℃雜交過夜(根據雜交情況可以調節)。
9.雜交后洗滌:揭掉蓋玻片,37℃左右水溫的2×SSC洗滌5分鐘×2次;37℃0.5×SSC洗滌15分鐘×1次; 37℃0.2×SSC洗滌15分鐘×1次(如果有非特異性染色,重復0.2×SSC洗滌15分鐘×1-2次)。
10.滴加封閉液:37℃30分鐘。甩去多余液體,不洗
11.滴加生物素化鼠抗dì高辛:37℃ 60分鐘或室溫120分鐘。原位雜交用PBS洗5分鐘×4次。勿用其它緩沖液和蒸餾水洗滌。
12.滴加SABC:37℃20分鐘或室溫30分鐘。原位雜交用PBS洗5分鐘×3次。勿用其它緩沖液和蒸餾水洗滌。
13.滴加生物素化過氧化物酶:37℃20分鐘或室溫30分鐘。原位雜交用PBS洗5分鐘×4次。
14.DAB顯色:使用DAB顯色試劑盒—1ml蒸餾水加顯色劑A,B,C各一滴,混勻,加至標本上。一般顯色20-30分鐘。若無背景出現則可繼續顯色。也可自配DAB顯色劑后顯色。充分水洗。
15.必要時蘇木素復染,充分水洗。
16.酒精脫水,二甲苯透明,封片。
二.石蠟切片
如果有條件的話,應盡可能地采用新鮮標本。標本離體后,及時予以固定。固定液為4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.0-7.6),含有1/1000 DEPC。標本較大時用刀片切成厚度不超過4mm的小塊,固定1小時即可,較大的標本固定不要超過2小時。某些組織對過度固定尤其敏感,如動物大腦,固定時間30-40分鐘,一般不要超過1小時。
1.常規脫水、浸蠟、包埋。切片厚度6-8μm。
2.玻片的處理:一般采用多聚賴氨酸或APES。
3.石蠟切片經常規脫蠟至水。30%H2O2 1份+蒸餾水10份混合,室溫5-10分鐘以滅活內源性酶。蒸餾水洗3次。
4.暴露mRNA核酸片段:切片上滴加3%檸檬酸新鮮稀釋的胃蛋白酶(1ml 3% 檸檬酸加2滴濃縮型胃蛋白酶,混勻),37℃或室溫消化3--30分鐘(視標本新舊、厚薄自行調整)。用戶可以比較不同的消化時間,例如5分鐘,10分鐘,20分鐘,30分鐘。以找到zuì佳的消化時間。原位雜交用PBS洗3次×5分鐘。蒸餾水洗1次。其余步驟和冰凍切片6-16步相同。
結果觀察:
Amelogenin/MAME的細胞胞漿著色呈棕黃色。
注意事項:
由于特定的mRNA序列僅占總mRNA的少數,加上基因僅由四個堿基排列組合而成,因此原位雜交容易出現非特異性染色。通過不加探針和用陰性標本做對照,基本可以確定染色是否為特異性的。有明顯的非特異性染色現象時,用預雜交液對含探針的雜交液進行稀釋,一般稀釋2—10倍;并應加強探針雜交后的洗滌。如果有少量的細胞核著色屬于正常情況;如果出現大量的細胞核著色,往往和標本固定時間過長有關,應重新處理標本。
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